Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms