Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms