Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CratP47934 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CratP47934 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CratP47934 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CratP47934 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CratP47934 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CratP47934 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CratP47934 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CratP47934 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CratP47934 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CratP47934 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CratP47934 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CratP47934 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CratP47934 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CratP47934 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CratP47934 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CratP47934 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CratP47934 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CratP47934 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CratP47934 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CratP47934 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CratP47934 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CratP47934 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CratP47934 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CratP47934 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CratP47934 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CratP47934 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CratP47934 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CratP47934 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CratP47934 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CratP47934 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CratP47934 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CratP47934 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CratP47934 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CratP47934 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CratP47934 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CratP47934 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CratP47934 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CratP47934 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms