Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax7P47239 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms