Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf4P43488 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms