Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gdf5P43027 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdf5P43027 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms