Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elk1P41969 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Elk1P41969 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Elk1P41969 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms