Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf2P39429 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf2P39429 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms