Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh4P39038 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms