Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1aP36536 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1aP36536 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1aP36536 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1aP36536 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1aP36536 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1aP36536 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1aP36536 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1aP36536 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1aP36536 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1aP36536 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1aP36536 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1aP36536 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1aP36536 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1aP36536 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1aP36536 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms