Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ddit3P35639 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms