Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab21P35282 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab21P35282 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab21P35282 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab21P35282 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab21P35282 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab21P35282 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab21P35282 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab21P35282 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab21P35282 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab21P35282 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab21P35282 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab21P35282 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab21P35282 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab21P35282 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab21P35282 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab21P35282 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab21P35282 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab21P35282 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms