Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rab5cP35278 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rab5cP35278 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rab5cP35278 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rab5cP35278 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rab5cP35278 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rab5cP35278 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rab5cP35278 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rab5cP35278 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rab5cP35278 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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