Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms