Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Stfa3P35173 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Stfa3P35173 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stfa3P35173 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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