Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms