Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Mmp13P33435 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Mmp13P33435 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Mmp13P33435 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Mmp13P33435 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Mmp13P33435 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Mmp13P33435 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Mmp13P33435 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Mmp13P33435 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Mmp13P33435 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms