Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Mmp13P33435 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Mmp13P33435 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Mmp13P33435 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Mmp13P33435 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Mmp13P33435 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mmp13P33435 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Mmp13P33435 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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