Protein–RNA interactions for Protein: P32115

Pax4, Paired box protein Pax-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax4P32115 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax4P32115 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax4P32115 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax4P32115 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax4P32115 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax4P32115 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax4P32115 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax4P32115 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax4P32115 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax4P32115 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax4P32115 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax4P32115 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax4P32115 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax4P32115 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax4P32115 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax4P32115 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax4P32115 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax4P32115 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax4P32115 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax4P32115 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax4P32115 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax4P32115 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax4P32115 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax4P32115 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax4P32115 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax4P32115 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms