Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SsbP32067 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SsbP32067 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SsbP32067 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SsbP32067 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SsbP32067 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SsbP32067 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SsbP32067 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SsbP32067 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SsbP32067 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SsbP32067 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SsbP32067 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SsbP32067 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SsbP32067 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SsbP32067 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SsbP32067 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SsbP32067 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SsbP32067 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SsbP32067 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SsbP32067 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SsbP32067 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SsbP32067 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SsbP32067 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SsbP32067 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SsbP32067 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SsbP32067 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SsbP32067 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SsbP32067 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SsbP32067 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms