Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc5P32043 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms