Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa10P31310 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms