Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms