Protein–RNA interactions for Protein: P30549

Tacr2, Substance-K receptor, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr2P30549 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr2P30549 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr2P30549 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms