Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VtnP29788 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VtnP29788 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VtnP29788 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VtnP29788 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VtnP29788 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VtnP29788 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VtnP29788 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VtnP29788 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VtnP29788 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VtnP29788 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VtnP29788 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VtnP29788 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VtnP29788 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VtnP29788 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VtnP29788 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VtnP29788 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VtnP29788 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VtnP29788 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VtnP29788 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VtnP29788 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VtnP29788 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VtnP29788 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VtnP29788 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VtnP29788 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VtnP29788 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VtnP29788 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VtnP29788 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VtnP29788 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VtnP29788 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VtnP29788 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VtnP29788 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VtnP29788 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VtnP29788 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VtnP29788 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VtnP29788 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VtnP29788 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VtnP29788 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VtnP29788 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VtnP29788 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VtnP29788 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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