Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nedd8P29595 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms