Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc1P29341 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms