Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkcdP28867 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms