Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif5cP28738 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms