Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gja4P28235 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja4P28235 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms