Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb9P28076 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms