Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabrg3P27681 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg3P27681 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg3P27681 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg3P27681 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg3P27681 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg3P27681 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg3P27681 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg3P27681 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg3P27681 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg3P27681 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg3P27681 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg3P27681 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms