Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms