Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms