Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms