Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk1P22518 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk1P22518 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk1P22518 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms