Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms