Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Fcer1aP20489 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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