Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP20293 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP20293 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TP20293 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TP20293 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TP20293 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TP20293 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TP20293 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TP20293 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TP20293 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TP20293 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TP20293 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TP20293 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TP20293 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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