Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms