Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NefhP19246 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NefhP19246 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NefhP19246 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NefhP19246 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NefhP19246 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NefhP19246 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NefhP19246 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NefhP19246 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NefhP19246 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NefhP19246 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NefhP19246 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NefhP19246 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NefhP19246 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NefhP19246 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NefhP19246 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NefhP19246 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NefhP19246 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NefhP19246 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NefhP19246 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NefhP19246 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NefhP19246 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NefhP19246 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NefhP19246 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NefhP19246 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NefhP19246 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NefhP19246 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NefhP19246 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NefhP19246 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NefhP19246 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NefhP19246 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NefhP19246 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NefhP19246 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NefhP19246 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NefhP19246 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NefhP19246 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NefhP19246 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NefhP19246 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NefhP19246 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NefhP19246 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NefhP19246 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NefhP19246 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NefhP19246 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NefhP19246 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NefhP19246 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NefhP19246 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NefhP19246 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NefhP19246 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NefhP19246 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NefhP19246 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NefhP19246 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NefhP19246 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NefhP19246 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NefhP19246 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NefhP19246 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NefhP19246 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NefhP19246 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms