Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama1P19137 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lama1P19137 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lama1P19137 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lama1P19137 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms