Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc1P18828 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms