Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb3P17125 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms