Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn1P12960 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms