Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms