Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms