Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtcP11725 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtcP11725 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtcP11725 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtcP11725 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtcP11725 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtcP11725 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtcP11725 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtcP11725 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtcP11725 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtcP11725 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OtcP11725 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OtcP11725 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
OtcP11725 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OtcP11725 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
OtcP11725 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OtcP11725 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OtcP11725 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OtcP11725 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OtcP11725 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
OtcP11725 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OtcP11725 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
OtcP11725 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OtcP11725 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms