Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DmdP11531 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DmdP11531 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DmdP11531 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DmdP11531 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DmdP11531 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DmdP11531 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DmdP11531 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DmdP11531 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DmdP11531 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DmdP11531 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DmdP11531 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DmdP11531 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DmdP11531 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DmdP11531 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DmdP11531 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DmdP11531 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DmdP11531 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DmdP11531 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DmdP11531 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DmdP11531 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DmdP11531 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DmdP11531 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DmdP11531 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DmdP11531 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DmdP11531 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DmdP11531 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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DmdP11531 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DmdP11531 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DmdP11531 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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DmdP11531 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DmdP11531 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DmdP11531 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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DmdP11531 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DmdP11531 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DmdP11531 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DmdP11531 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DmdP11531 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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DmdP11531 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DmdP11531 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DmdP11531 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DmdP11531 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DmdP11531 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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DmdP11531 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DmdP11531 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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DmdP11531 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DmdP11531 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DmdP11531 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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DmdP11531 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DmdP11531 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DmdP11531 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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DmdP11531 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DmdP11531 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DmdP11531 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DmdP11531 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DmdP11531 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DmdP11531 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DmdP11531 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DmdP11531 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DmdP11531 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DmdP11531 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DmdP11531 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DmdP11531 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DmdP11531 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DmdP11531 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DmdP11531 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DmdP11531 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DmdP11531 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms