Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms