Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms